Молекулярно-біологічна характеристика нового для України Х-вірусу хости
Тип публікації :
Дисертація
Дата випуску :
2018
Автор(и) :
Щетиніна Ганна Сергіївна
Науковий(і) керівник(и)/редактор(и) :
Будзанівська Ірина Геннадіївна
Мова основного тексту :
ua
uk_UA
eKNUTSHIR URL :
Цитування :
[APA 7] Щетиніна, Г. С. (2018). Молекулярно-біологічна характеристика нового для України Х-вірусу хости. [Дис. канд. біол. наук, Київський національний університет імені Тараса Шевченка]. eKNUTSHIR. https://ir.library.knu.ua/handle/123456789/851
[ДСТУ] Щетиніна Г. С. Молекулярно-біологічна характеристика нового для України Х-вірусу хости : дис. … канд. біол. наук : 09 Біологія. Київ, 2018. 132 с. URL: https://ir.library.knu.ua/handle/123456789/851 (дата звернення: 18.07.2026).
Вперше була отримана повногеномна послідовність українського ізоляту Х-вірусу хости, аналіз якої виявив мутацію (AUG UUG) у старт-кодоні гена білка руху. Для детального дослідження зразки листя Hosta tratt відбиралися за візуальними симптомами, такими як: системний, прожилковий та міжжилковий хлорози, знебарвлення, скручування, гофрування та некротизація листків. Загалом було відібрано п’ять зразків хости чотирьох різних сортів: Hosta Sum and substance (1), Hosta Sum and substance (2), Hosta Striptease, Hosta Lady Guinevere, Hosta X. В результаті серологічного дослідження методом ІФА з використанням Ат до Х-вірусу картоплі було детектовано серологічний вірусний агент у зразку Hosta Sum and substance (зразок 2). За допомогою електронно-мікроскопічного дослідження були візуалізовані вірусні частки з морфологією характерною для представників роду Potexvirus. Український ізолят Х-вірусу хости був використаний для отримання специфічної антисироватки. Вірус був виділений з рослин хости сорту Sum and substance, очищений та сконцентрований методом диференційного центрифугування. Методом Next generation sequencing вперше у Європі була отримана повногеномна послідовність ХВХ. Аналіз повногеномної послідовності українського ізоляту ХВХ (6430 bp) (GenBank: KX033798.1) з іншими ізолятами продемонстрував 99% ідентичності з американським ізолятом HVX-37 та 97,5% подібності з ізолятом з Кореї, HVX-Kr. Усі ізоляти ХВХ утворили окрему кладу, відокремившись від ізолятів ХВК при 100% значенню бутстреп підтримки. Була виявлена заміна амінокислоти у старт-кодоні ORF4 гена білка руху. Наявність неконсервативного старт-кодону підтвердилося додатковим секвенуванням за Сенгером. В українському ізоляті ініціація відбувається з кодона UUG, як і в ізолята зі Сполучених Штатів (U.S. isolate; JQ911698, однак у ізолята з Кореї такої заміни виявлено не було (Korean isolate; AJ620114).
Галузі знань та спеціальності :
09 Біологія
091 Біологія та біохімія
Файл(и) :![Ескіз]()
Вантажиться...
Формат :
Adobe PDF
Розмір :
2.69 MB
Контрольна сума :
(MD5):74661708c1dd6e9c8f3c293cdea9b0cc
Якщо не вказано інше, ця робота розповсюджується на умовах ліцензії Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International