Раціональний дизайн інгібіторів тирозинкінази JAK1

Васильчук М. О. Раціональний дизайн інгібіторів тирозинкінази JAK1 : випускна кваліфікаційна робота магістра : 102 Хімія / наук. кер. С. В. Рябухін, М. В. Протопопов. Київ, 2024. 70 с.

Випускна кваліфікаційна робота присвячена раціональному дизайну інгібіторів протеїнкінази JAK1 з використанням методів комп’ютерного моделювання. Функціонування JAK1 тісно пов’язане із процесами кровотворення, відновлення тканин, імунної відповіді, апоптозу та запалень. Розробка інгібіторів даної протеїнкінази є важливою ланкою у процесі пошуку ліків від ряду захворювань, включаючи різні типи ракових пухлин, аутоімунні порушення, хворобу Паркінсона, астму, ревматоїдний артрит, атопічний дерматит, тощо. У даній роботі було проведено віртуальний скринінг у два етапи. Спочатку було виконано ліганд-орієнтований скринінг, а після цього - рецептор-орієнтований. Нами було проаналізовано тримільйонну колекцію сполук із метою пошуку потенційних інгібіторів JAK1 за допомогою методів розпізнавання молекулярної форми APF RIDE та USRCAT, що враховують структурні та фармакофорні властивості. Для виявлення біологічно активних лігандів протеїнкінази JAK1 було застосовано метод 4D молекулярного докінгу у поєднанні із подальшим in vitro тестуванням інгібувальної здатності кандидатів. У результаті дослідження було знайдено два неселективних інгібітора протеїнкінази JAK1 із показниками ІС50 41,3 та 30,1 мкМ.