Порівняльний аналіз методів виявлення та кількісної оцінки ліній sars-cov-2 у зразках стічних вод
Тип публікації :
Магістерська робота
Дата випуску :
2023
Автор(и) :
Тищенко Богдан Юрійович
Мова основного тексту :
ua
eKNUTSHIR URL :
Цитування :
[APA 7] Тищенко, Б. Ю. (2023). Порівняльний аналіз методів виявлення та кількісної оцінки ліній sars-cov-2 у зразках стічних вод [Магістерська робота, Київський національний університет імені Тараса Шевченка]. eKNUTSHIR. https://ir.library.knu.ua/handle/123456789/4820
[ДСТУ] Тищенко Б. Ю. Порівняльний аналіз методів виявлення та кількісної оцінки ліній sars-cov-2 у зразках стічних вод : кваліфікаційна робота магістра : 09 Біологія. Київ, 2023. 40 с. URL: https://ir.library.knu.ua/handle/123456789/4820 (дата звернення: 25.07.2026).
У роботі проведено оцінку і порівняння ефективності методів детекції ліній на даних SARS-COV-2, включаючи CliqueSNV, PredictHaplo, aBayesQR та gromstole. Згенеровано масивні штучні набори даних рідів зі зразками 11ти варіантів SARS-COV-2, які можуть слугувати основою для оцінки якості та надійності алгоритмів виявлення варіантів і визначення їх концентрацій.
Отримані результати вказують на проблеми в роботі деяких методів з наборами даних повного геному, а також на можливості покращення результатів за допомогою налаштування параметрів алгоритмів. Отримані результати можуть бути використані для вдосконалення існуючих та розробки нових методів детекції варіантів SARS-COV-2, а також для визначення найбільш ефективних підходів для аналізу даних про варіанти цього вірусу.
Ключові слова : порівняльний аналіз, детекція ліній, SARS-COV-2, стічні води, CliqueSNV, PredictHaplo, aBayesQR, gromstole
Отримані результати вказують на проблеми в роботі деяких методів з наборами даних повного геному, а також на можливості покращення результатів за допомогою налаштування параметрів алгоритмів. Отримані результати можуть бути використані для вдосконалення існуючих та розробки нових методів детекції варіантів SARS-COV-2, а також для визначення найбільш ефективних підходів для аналізу даних про варіанти цього вірусу.
Ключові слова : порівняльний аналіз, детекція ліній, SARS-COV-2, стічні води, CliqueSNV, PredictHaplo, aBayesQR, gromstole
Галузі знань та спеціальності :
09 Біологія
091 Біологія та біохімія
Файл(и) :![Ескіз]()
Вантажиться...
Формат :
Adobe PDF
Розмір :
1.45 MB
Контрольна сума :
(MD5):821f0558a653ffed2a40d0104d1792bc
Якщо не вказано інше, ця робота розповсюджується на умовах ліцензії Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International