ФІЛОГЕНЕТИЧНИЙ АНАЛІЗ ІЗОЛЯТІВ ВІРУСІВ МОЗАЇКИ ЦИМБІДІУМУ ТА КІЛЬЦЕВОЇ ПЛЯМИСТОСТІ ОДОНТОГЛОСУМУ, ВИДІЛЕНИХ ІЗ ОРХІДНИХ PHALAENOPSIS SP.

ПОНОМАРЕНКО, А., КОРОТЄЄВА, Г., БУДЗАНІВСЬКА, І., ШЕВЧЕНКО, Т. (2021). PHYLOGENETIC ANALYSIS OF CYMBIDIUM MOSAIC AND ODONTOGLOSSUM RINGSPOT VIRUSES ISOLATED FROM PHALAENOPSIS SP.. Вісник Київського національного університету імені Тараса Шевченка. Біологія, 87(4), 56–61. https://doi.org/10.17721/1728.2748.2021.87.56-61

Віруси мозаїки цимбідіуму та кільцевої плямистості одонтоглосуму є найбільш патогенними та широко поширеними вірусами в колекціях декоративних орхідних. Інфекції, спричинені цими вірусами, можуть призвести до зниження видового різноманіття колекцій і, як наслідок, їх повного виснаження. Метою дослідження було визначення походження українських ізолятів вірусів орхідних у колекції захищеного ґрунту Ботанічного саду імені О. В. Фоміна Київського національного університету імені Тараса Шевченка. Вивчено нуклеотидні та амінокислотні послідовності гена капсидного білка (CP) вірусу мозаїки цимбідіуму (CymMV) та CP вірусу кільцевої плямистості одонтоглосуму (ORSV). Ці послідовності були отримані в результаті ампліфікації і сиквенування РНК CymMV та ORSV, виділених із інфікованих рослин Phalaenopsis sp. колекції захищеного ґрунту Ботанічного саду ім. О. В. Фоміна Київського національного університету імені Тараса Шевченка. Отримані сиквенси порівнювали з послідовностями відомих ізолятів CymMV та ORSV із ГенБанку. Було встановлено, що досліджуваний ізолят ORSV має подібність з іншими ізолятами 96–99 % та 93,4–98 % для CP на нуклеотидному й амінокислотному рівнях, відповідно. Виділений ізолят CymMV мав ступінь подібності з іншими ізолятами CymMV 77–97 % для нуклеотидних та 84–100 % – для амінокислотних послідовностей. Побудоване філогенетичне дерево показало, що обидва досліджувані віруси, CymMV та ORSV, мають спільне походження з деякими корейськими ізолятами.