ФІЛОГЕНЕТИЧНИЙ АНАЛІЗ ІЗОЛЯТІВ ВІРУСУ ЖОВТОЇ МОЗАЇКИ КВАСОЛІ З ГЛАДІОЛУСІВ В УКРАЇНІ

ДУНІЧ, А., СОВІНСЬКА, Р., ДАЩЕНКО, А., МІЩЕНКО, Л. (2022). PHYLOGENETIC ANALYSIS OF BEAN YELLOW MOSAIC VIRUS ISOLATES FROM GLADIOLI IN UKRAINE. Вісник Київського національного університету імені Тараса Шевченка. Біологія, 89(2), 14–18. https://doi.org/10.17721/1728.2748.2022.89.14-18

Вірус жовтої мозаїки квасолі (ВЖМК) є одним із найбільш поширених та шкодочинних вірусів, що уражують рослини гладіолусів у світі. Метою роботи було провести філогенетичний аналіз двох українських ізолятів ВЖМК, виділених із гладіолусів різних областей України та визначити філогенетичні зв’язки ізолятів з іншими ізолятами цього вірусу. У дослідженні були використані методи: візуальна діагностика, імуноферментний аналіз у модифікації сендвіч, виділення тотальної РНК, ЗТ-ПЛР, філогенетичний аналіз, статистичні методи обробки даних. Результати досліджень показали, що гладіолуси сорту Пам’ять (Полтавська область, 2018) та сорту Галина Зеленобірська (Київська обл., 2020) з симптомами хлоротичної штрихуватої мозаїки на листках і розриву кольору квітки інфіковані ВЖМК.  Послідовності фрагмента гена CP українських гладіолусних ізолятів вірусу жовтої мозаїки квасолі, названі GlMP-18 (MK416160) та BYMV-Gl-SV-20 (MZ286966), депоновані до NCBI GenBank. Нуклеотидні послідовності цих ізолятів, які відповідають ділянці гена СР розміром 578 нуклеотидів, локалізованій у позиціях 8727–9305 вірусного геному, а також амінокислотні послідовності, порівняні з 40 відомими ВЖМК ізолятами/штамами. Філогенетичний аналіз показав, що GlMP-18 і BYMV-Gl-SV-20 мають між собою ідентичність 100% і за нуклеотидною, і за амінокислотною послідовністю. Обидва українські ізоляти належать до групи Monocot. Ідентичність двох гладіолусних ізолятів GlMP-18 і BYMV-Gl-SV-20 за ділянкою гена СР з територіально віддалених областей країни та у різні роки відбору свідчать  про спільне походження ізолятів та ймовірне їх поширення посадковим матеріалом.