Пошук in Silico лігандів для доменів SH2

Гурмач В. В. Пошук in Silico лігандів для доменів SH2 : автореф. дис. ... канд. біол. наук : 03.00.02 Біофізика / Гурмач Василь Васильович. - Київ, 2016. –23 с.

Мета роботи полягає у створенні цільової бібліотеки потенційних лігандів доменів SH2 та їх перевірці на біологічних моделях.
Об’єкт дослідження – домени SH2, низькомолекулярні ліганди.
Предмет дослідження – фізико-хімічні властивості кишені зв’язування доменів SH2, структурні особливості активних речовин щодо доменів SH2, нековалентна взаємодія комплексу “домен-ліганд”.
Використовуючи наявні бази даних структур доменів SH2 та активних речовин щодо них, проведено розподіл цих доменів на групи/кластери, виділено шаблонні структури та відібрано репрезентативний сет речовин з наявного пулу низькомолекулярних потенційних лігандів; оцінено геометричні характеристики відібраних доменів SH2 та порівняно їх; виділено ключові точки зв’язування доменів SH2 з нативними лігандами; створено цільову бібліотеку потенційних лігандів доменів SH2; проведено експериментальну перевірку отриманих сполук щодо їх впливу на проліферацію пухлинних ліній клітин K562, U937, A431 і LNCap та кіназну активність Btk та Syk.