Філогенетичний аналіз гена капсидного білка ізолятів вірусу мозаїки томату, що циркулюють в Україні
Тип публікації :
Стаття
Дата випуску :
1 березня 2019 р.
Автор(и) :
Пожилов І.
Руднєва Т.
Шевченко Т.
Шевченко О.
Цвігун В.
Мова основного тексту :
Ukrainian
eKNUTSHIR URL :
Випуск :
1(77)
ISSN :
1728-2748
Початкова сторінка :
44
Кінцева сторінка :
49
Цитування :
[APA 7] Пожилов, І., Руднєва, Т., Шевченко, Т., Шевченко, О., & Цвігун, В. (2019). Філогенетичний аналіз гена капсидного білка ізолятів вірусу мозаїки томату, що циркулюють в Україні. Вісник Київського національного університету імені Тараса Шевченка. Біологія, (1(77)), 44–49. https://ir.library.knu.ua/handle/15071834/28917
[ДСТУ] Філогенетичний аналіз гена капсидного білка ізолятів вірусу мозаїки томату, що циркулюють в Україні / І. Пожилов та ін. Вісник Київського національного університету імені Тараса Шевченка. Біологія. 2019. № 1(77). С. 44—49. URL: https://ir.library.knu.ua/handle/15071834/28917 (дата звернення: 02.08.2026).
Вірус мозаїки томатів (ВМТо) викликає контагіозні захворювання овочевих культур, а у випадку контамінації насіння і повну втрату врожаю. Метою роботи було встановлення філогенетичної спорідненості українських ізолятів ВМТо, виділених з рослин томатів, з відомими ізолятами шляхом порівняння гена капсидного білка. Методи: ІФА, електронна мікроскопія, ЗТ-ПЛР, аналіз нуклеотидного сиквенсу за допомогою програми MEGA 5. Сиквеновані нуклеотидні послідовності капсидного білка двох нових українських ізолятів ToMV-ukr-5 і ToMV-ukr-10 були порівнянні між собою та з відомими ізолятами ВМТо. Побудова філогенетичного дерева дозволила об'єднати досліджувані штами та ізоляти ToMV у два окремі кластери. Ізоляти ToMV-ukr-5 та ToMV-ukr-10 увійшли до першого кластера разом з ще 28 досліджуваними ізолятами, відсоток гомології у яких з українськими ізолятами становив 96-98,9 %. У межах першого кластера чітко виділяються два субкластери: до першого входять ізоляти, відсоток гомології яких з українськими ізолятами становить більше 96,7 %, а до другого – три штами та ізоляти з відсотком гомології 96,1 % відносно українських ізолятів: ізолят SL-1, штам camellia та ізолят Dahlemense DSMZ PV-0135. Два ізоляти вірусу мозаїки томатів ToMV-ukr-5 і ToMV-ukr-10 були виділені з рослин томатів відкритого ґрунту різних регіонів України. У філогенетичному аналізі показано високу спорідненість українських ізолятів між собою і з уже відомими штамами та ізолятами цього вірусу за геном капсидного білка. Найбільш високий відсоток гомології (>98 %) українські ізоляти мали з бразильським ізолятом Hemerocallis, китайським ізолятом G2 та томатними ізолятами AH4, Queensland, ToMV-tom і Ls-K, S14 та FERA_160205. Гомологія ізолятів простежувалась незалежно від джерела виділення вірусу, виду рослини-хазяїна та їх географічного поширення.
Файл(и) :![Ескіз]()
Вантажиться...
Формат :
Adobe PDF
Розмір :
443.8 KB
Контрольна сума :
(MD5):30b0100066c27d5ee42c5dbcdf8ed44b